Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms