Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW49

SPESP1, Sperm equatorial segment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPESP1Q6UW49 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPESP1Q6UW49 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms