Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q6Q795 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q6Q795 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q6Q795 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q6Q795 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6Q795 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6Q795 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6Q795 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6Q795 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6Q795 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6Q795 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6Q795 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6Q795 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6Q795 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6Q795 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6Q795 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6Q795 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6Q795 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6Q795 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6Q795 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6Q795 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6Q795 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6Q795 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6Q795 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms