Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNV1Q6PIU1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms