Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms