Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms