Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPPQ6IPU0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms