Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL2Q6F5E8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL2Q6F5E8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms