Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNS3Q68CZ2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNS3Q68CZ2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms