Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms