Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOCADQ5VW36 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms