Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf53Q5VUE5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms