Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF20Q5VTR2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms