Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AGAP9Q5VTM2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms