Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms