Protein–RNA interactions for Protein: Q5TBE3

C9orf153, Uncharacterized protein C9orf153, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf153Q5TBE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf153Q5TBE3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf153Q5TBE3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms