Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms