Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCID2Q5JVF3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms