Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms