Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms