Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AA4PQ58FG1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms