Protein–RNA interactions for Protein: Q53LP3

SOWAHC, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOWAHCQ53LP3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOWAHCQ53LP3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOWAHCQ53LP3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms