Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZC2HC1CQ53FD0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms