Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARHGAP29Q52LW3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms