Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms