Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
COX19Q49B96 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX19Q49B96 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms