Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFNL1Q499Z3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFNL1Q499Z3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms