Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms