Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms