Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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