Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDO1Q16878 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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