Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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