Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFA9Q16795 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms