Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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