Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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SSX1Q16384 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SSX1Q16384 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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