Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms