Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMCHL1Q16048 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL1Q16048 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms