Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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