Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP3Q15836 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms