Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIP11Q15643 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms