Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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