Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK1Q15118 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK1Q15118 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms