Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
R3HDM1Q15032 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
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