Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms