Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD9Q14511 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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