Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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