Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKP1Q13835 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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