Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALCAMQ13740 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
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