Protein–RNA interactions for Protein: Q13642

FHL1, Four and a half LIM domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL1Q13642 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FHL1Q13642 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FHL1Q13642 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FHL1Q13642 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FHL1Q13642 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FHL1Q13642 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FHL1Q13642 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FHL1Q13642 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FHL1Q13642 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FHL1Q13642 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FHL1Q13642 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FHL1Q13642 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FHL1Q13642 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms