Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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